Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD55Q3KP44 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms