Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWISTNBQ3B726 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWISTNBQ3B726 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms