Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDO1Q16878 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CDO1Q16878 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CDO1Q16878 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CDO1Q16878 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CDO1Q16878 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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