Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2B3Q16720 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B3Q16720 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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