Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRF1Q16656 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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NRF1Q16656 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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