Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USF2Q15853 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
USF2Q15853 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USF2Q15853 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USF2Q15853 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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