Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VAMP3Q15836 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VAMP3Q15836 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VAMP3Q15836 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VAMP3Q15836 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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VAMP3Q15836 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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VAMP3Q15836 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VAMP3Q15836 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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