Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC85BQ15834 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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