Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
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NCOA1Q15788 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA1Q15788 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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