Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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