Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms