Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUM3Q15397 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PUM3Q15397 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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