Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC1AQ14683 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC1AQ14683 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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