Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNQ14247 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNQ14247 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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