Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms