Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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