Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ALCAMQ13740 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms