Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms