Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FHL3Q13643 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FHL3Q13643 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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