Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDH18Q13634 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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