Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4AQ13619 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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