Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL3Q13618 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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