Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PKD2Q13563 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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