Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3BPQ13352 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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