Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CALCOCO2Q13137 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms