Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPS1Q13098 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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