Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRDNQ13061 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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