Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSPB3Q12988 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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