Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBRQ0VD83 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms