Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms