Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP4Q07065 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms