Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNDQ07001 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNDQ07001 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms