Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR4Q05215 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms