Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms