Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB1Q02818 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB1Q02818 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms