Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DSG1Q02413 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSG1Q02413 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms