Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BEX3Q00994 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms