Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms