Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK6Q00534 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms