Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM258P61165 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms