Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB2AP61019 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB2AP61019 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms