Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms