Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ELLP55199 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ELLP55199 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELLP55199 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELLP55199 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms