Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN1P54253 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATXN1P54253 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms