Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDST1P52848 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDST1P52848 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDST1P52848 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDST1P52848 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDST1P52848 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms