Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1P51787 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNQ1P51787 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms