Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAMP50895 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCAMP50895 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCAMP50895 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms