Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms