Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms