Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHKA1P46020 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHKA1P46020 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms